הבחירה בין גישור לבוררות תלויה בסוג הסכסוך ובצרכים של הצדדים המעורבים. גישור הוא תהליך שבו המגשר מסייע לצדדים להגיע לפתרון מוסכם, בעוד שבוררות היא הליך פורמלי שבו הבורר מקבל החלטה מחייבת. כל אחד מהתהליכים הללו יש לו יתרונות וחסרונות, ולכן חשוב להבין מה מתאים יותר לכל מצב.
גישור מתמקד בהבנה והסכמה של הצדדים. הוא מציע סביבה גמישה שבה הצדדים יכולות לנהל משא ומתן ולמצוא פתרונות שמתאימים לצרכים של כל אחד מהם. תהליך זה מאפשר שיח פתוח וכולל בדרך כלל פחות בירוקרטיה מאשר הליך משפטי. יתרון מרכזי של גישור הוא היכולת לשמור על מערכת יחסים עסקית, שכן הוא מבוסס על שיתוף פעולה והבנה הדדית.
בוררות, לעומת זאת, היא הליך פורמלי שבו הבורר מקבל החלטה מחייבת. בוררות מתאימה כאשר הצדדים זקוקים להכרעה חד משמעית ובלתי ניתנת לערעור. היא מתאימה במיוחד במקרים שבהם יש צורך בפתרון מיידי וברור, והצדדים אינם
מצליחים להגיע להסכמות בעצמם. בוררות גם יכולה להיות בעלת יתרון במצבים שבהם יש צורך בהליך משפטי מהיר ומדויק.
הבחירה בין גישור לבוררות תלויה גם בסוג הסכסוך וביחסים בין הצדדים. כאשר יש רצון טוב, כשחשוב לשמור על יחסים טובים ולמנוע מחלוקות נוספים, גישור הוא לרוב הבחירה הנכונה. כאשר יש צורך בהחלטה סופית ובלתי ניתנת לערעור ואין עתיד עסקי נראה בעין, בוררות עשויה להיות מתאימה יותר.